Stephanie Hutin

Qualifications
Sep. 2019- maintenant : Attaché Temporaire d'Enseignement et de Recherche (ATER) à l'Université Grenoble Alpes et Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale (LPCV) Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG). Dans le contexte des facteurs de transcription de la florogenèse et de la morphogenèse des organes floraux, j'ai déterminé la dépendance à la température de la formation du complexe du soir et décrit la séparation de phase liquide-liquide du domaine de type prion de l'un de ses protéines, ELF3.
Mar. 2018 – Dec 2018 : Ingénieur aux Laboratoires Européens de Rayonnement Synchrotron, Grenoble, dans le groupe Biologie Structurale, j'ai effectué des tâches de contact local, assuré l’interface avec les clients industriels, et optimisé des manuels d'utilisation de lignes de lumière.
Mar. 2014 - Dec 2017 : Post-doc CNRS à Unit of Virus Host Cell interactions UMI 3265 UJF-EMBL-CNRS, Grenoble, France dans le groupe de Wim Burmeister. Dans le contexte de l’élucidation structurale et fonctionnelle du processus de réplication du génome du poxvirus, j’ai mené l’analyse de l’hélicase-primase D5.
Oct. 2011- Nov.2013 : Post-doc à UC Berkeley, Department of Plant and Microbial Biology, Glaunsinger Lab, Berkeley, CA, USA. Utilisation de l’Herpèsvirus humain type 8 (KSHV) phenotype “host shutoff” pour étudier les ARNm échappant à leur dégradation.
Juin. 2011 - Sept.2011 : Assistante de Recherche à European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Grenoble, France études structurales de la couche S des protéines de Deinococcus radiodurans et des facteurs de transcriptions d’Arabidopsis thaliana.
Apr. 2007 - Apr. 2011 : Thèse de doctorat à EMBL Outstation et Université Joseph Fourier, Grenoble, France sur le sujet “Le complexe MILI/mHEN1 et études fonctionnelles de DrTDRD1 et DrMOV10L” dans le groupe de Ramesh Pillai.
Juil. 2006 - Mar. 2007 : Diploma de Biologie (équivalent Master 2) à Universität Kassel, Allemagne
Stages :
Sept. – Déc. 2005 : Département de Biologie Moléculaire, Centre Biomédical Swedish University of Agricultural Sciences Uppsala, Suède dans le groupe de Fredrik Söderbom: Studies of structure and function of Eri-1 in Dictyostelium discoideum.
Juil. 2005 : LHL, Kassel, Allemagne: Detection of the presence of mycotoxin, meat and bone meal in animal food; microbiological and chemical study of milk products.
Fév. 2005 : Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) à Gatersleben, Allemagne: Studies of cytogenetics and molecular biology methods.
2004-2005 : Universität Kassel: Département de Physiologie Végétale de Prof. Dr. U. Kutschera: Studies of influence of pink-pigmented facultatively methylotrophic bacterias on Cycadaceae, Pinus sylvestris and Gingko biloba et un stage approfondi intitulé Methods in Plant Physiology.
Département de Génétique Moléculaire de Prof. Dr. W. Nellen: Researching a double knock-out and streptavidin knock-in at Dicer A for immunoprecipitation in D. discoideum.
Département de Biochimie de Prof. Dr. F.W. Herberg: Studies of binding constants of cAMP analogues on the regulatory subunit of Protein kinase A.
Compétences
Méthodes de biochimie et biologie moléculaire : Techniques de culture cellulaire (mammifères, Bombyx mori, Sf21, etc.), Agrobacterium tumefaciens-mediated transfection dans Tabacco et Arabidopsis plants, mise en place et maintenance d’une installation de culture de poissons zèbres, expression hétérologue dans les systèmes bactériens et de la levure, procédure de clonage, PCR (qPCR et RT-PCR) et mutagénèse site spécifique, PAGE-SDS et western, régulation de l’expression des gènes, biochimie de l’ARN, immunopréciptation des protéines et de l’ARN, marquage immunofluorescent et radioactif des acides nucléiques, hybridation in situ, micro-injection, analyses spectrophotométriques, microscopie par immunofluorescence (Axio Imager M1 and M2, confocal: Leica SP2), purification des protéines, essais enzymatiques, expériences de diffusion de rayons X à angle petit, méthode de cristallographie et système double hybride.
Systèmes modèles: lignée cellulaires humaines, souris et taureaux, Bombyx mori, Arabidopsis thaliana, Nicotiana benthamiana, Dictyostellium discoideum.
Méthodes de biologie structurale : Crystallographie des macromolecules: Crystallisation, collect de données, resolution des structures, operation et depannage des lignes de lumière de biologie structurale à l’ESRF.
Microscopie électronique à molecule unique: préparation d'échantillons, acquisition de données et interprétation (F20, Polara).
Diffusion des rayons X aux petits angles: Préparation et évaluation des échantillons, acquisition, analyse et interprétation des données, exploitation et dépannage de la ligne de lumière ESRF BM29.
Informatique : Programmation: Python.
Logiciels d’analyse de données structurales: ATSAS, Scatter, Boxer, Relion, XDS et CCP4, PyMol, Coot, ccCluster, Pointless, Aimless etc.
Other: logiciels de microscopie, recherches dans les bases de données bio-informatiques, programme d’analyse de séquences complètes (Bowtie, TopHat, Cufflinks, CummeRbund), Prism, Vector NTI, Oligo, ImageJ.
Operation systems: Windows, Linux, OSX.
Ensignments :
Encadrement de 3 étudiants de niveau Master 2, une étudiante niveau Licence et 3 étudiants L3, M1
Chargée de TD C2i et de informatiques pour étudiants de 2ème et 3ème année de Licence en Pharmacie, TP et TD en biochimie (L1 et L2), biologie cellulaire (L2), biologie animale (L1), physiologie végétale (L2), et TD en évolution végétale (M1).
Organisation du Symposium decision making in biology, Heidelberg 2008, secouriste. Organisation de retrait de laboratoire 2013, Fête de la Science.
Langues Allemand: langue maternelle, English: bilingue, Français et Latin: niveau intermédiaire, Italien, Grec et Suédois: bases.