Setelah ditetapkan Peraturan Presiden Nomor 130 Tahun 2014, Institut Agama Islam Negeri (IAIN) Walisongo menjadi Universitas Islam Negeri (UIN) Walisongo. Pada Maret 2019, Surat Keputusan (SK) nomor 49/SK/BAN-PT/Akred/PT/III/2019 yang dikeluarkan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) mengumumumkan UIN Walisongo berhasil meraih peringkat akreditasi “A”. Akreditasi tersebut berlaku hingga 5 Maret 2024. Kini UIN Walisongo memiliki 8 Fakultas dan 39 Program Studi (Prodi).