Florence Débarre est chercheuse en biologie évolutive, spécialiste de modélisation en écologie et épidémiologie évolutives.
Ses projects de recherche actuels portent sur la pandémie de Covid-19. Elle travaille notamment au suivi de l'évolution des différents variants et leurs impacts sur la dynamique épidémique et l'efficacité vaccinale. En parallèle, elle s'intéresse au sujet de la recherche de l'origine de la pandémie, et aux flux d'information et de désinformation sur le sujet, en particulier dans les médias.
Elle continue également à travailler sur ses projets de recherche antérieurs à la pandémie, qui portent sur le forçage génétique.
Elle est directrice de recherche au CNRS. Elle travaille à l'Institut d'écologie et des sciences de l'environnement, une unité de recherche hébergée par Sorbonne Université, à Paris.
Médaille de Bronze du CNRS (2022). Prix jeune chercheur de la Société Française d'Écologie (2011)