Ongku Hasibuan menyelesaikan pendidikan S1 Teknik Elektro di ITB Bandung, S2 Manajemen Bisnis di Prasetya Mulya Business School Jakarta, dan S3 Manajemen Science di ITB Bandung. Ia juga telah mengikuti berbagai program pengembangan eksekutif di berbagai lembaga pendidikan terkemuka dunia, antara lain di INSEAD - Perancis, Petroleum Economist - Inggris, MIT Sloan School of Management – Amerika Serikat, Tsinghua University - China, dan LEMHANAS - RI.