Bernard Kaufmann est maître de conférences à l’Université Claude Bernard Lyon 1 depuis 2001, où il enseigne l’écologie et la zoologie.
Ses recherches conduites au LEHNA (Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés) se focalisent sur l’écologie urbaine et écologie des invasions biologiques, en intégrant une forte pluralité associant chercheurs (géographes, informaticiens) et praticiens (associations, territoires).