José Prenda es Catedrático de Zoología en la Universidad de Huelva donde dirige, desde su creación, el Máster Oficial en Conservación de la Biodiversidad y enseña "Biología de la Conservación". Es asimismo representante de la Universidad andaluza en el Consejo de Participación Pública del Espacio Natural Doñana. Entre 2006 y 2011 fue Presidente del Centro Internacional de Estudios y Convenciones Ecológicas (CIECEM), perteneciente a la Junta de Andalucía y gestionado por la Universidad de Huelva. A lo largo de sus más de 30 años de experiencia investigadora se ha interesado por la ecología, la biodiversidad y la conservación de los medios acuáticos epicontinentales, labor desarrollada en diferentes universidades y centros de investigación nacionales (Universidades de Sevilla, Córdoba y Huelva), y extranjeros (Institute of Freshwater Ecology -Reino Unido- Universidad de Lisboa). Esta actividad ha sido consecuencia de la dirección de cuatro proyectos de investigación concedidos en convocatorias públicas y de más de medio centenar de contratos de investigación con entidades públicas y privadas, que le han permitido publicar más de un centenar de trabajos científicos. En la actualidad investiga sobre la biodiversidad de las aves y su estado de conservación en espacios agrarios y urbanos.